Златоустов монастырь просуществовал на одном месте более 500 лет, он был стерт с лица земли в 1937 году, но в 2011 году заявил о себе. Тогда же возник Центр изучения истории и наследия Златоустова монастыря.
В 2018 году в переулках, расположенных рядом с Московским Златоустовским монастырем проходила программа «Моя улица», которая сопровождалась работой археологов. В результате было обнаружено много артефактов, которые легли в основу музея, ставшего внешней экспозицией музея Москвы.
Прекрасное название музея «Разрушенный, но живой», как нельзя более полно передает суть не только экспозиции музея, но и современной жизни этого уникального места.
В музее также можно рассмотреть точный макет Златоустова монастыря, чтобы представить его в самых мельчайших деталях.